Miles Morales vit avec sa mère et son père policier à Brooklyn. Après sa rencontre avec Peter Parker, le Spider-Man originel, Miles découvre le Spider-Verse qui permet de devenir un superhéros dans sa propre dimension. Il est alors amené à devenir le Spider-Man de son univers. Avec d'autres superhéros d'univers différents, comme Spider-Gwen et Spider-Ham, il va devoir affronter des supervilains : Wilson Fisk, le Caïd, le Ranger, Octavius, Tombstone, le Scorpion et le Bouffon vert...