Scooby-Doo a vécu une expérience terrifiante dans une maison hantée et a besoin de se mettre au repos. Toute l'équipe prend la route du Nouveau-Mexique, où Scooby-Doo doit passer quelques jours à se détendre dans le spa de monsieur Hubley. Un jour qu'ils doivent visiter un site paléontologique, dont les fouilles sont supervisées par le professeur Svankmajor, Scooby-Doo et Sammy s'éloignent du groupe et tombent nez à nez avec un dinosaure terrifiant, le Phantosaure...