Après la destruction du S.H.I.E.L.D., les Avengers ont désormais cessé d'opérer. Tony Stark décide alors de relancer un programme spécial de maintien de paix, Ultron, afin de protéger l'humanité contre les menaces potentielles. Mais lorsque Ultron, un être technologique à l'intelligence artificielle surdéveloppée, s'emploie à exterminer les humains, les super-héros Iron Man, Captain America, Thor, Hulk, la Veuve noire et Oeil de Faucon doivent unir leurs forces pour affronter leur adversaire le plus terrifiant. Alors qu'une redoutable bataille s'engage, trois individus dotés de facultés extraordinaires font leur apparition : Vif-Argent, Vision et la Sorcière rouge.