Le jeune Sho passe quelques jours chez sa tante avant de subir une importante opération. Ce que le petit garçon ne sait pas, c'est qu'il n'est pas le seul à être hébergé par sa tante. Sous le plancher de la maison, vivent Arrietty, son père et sa mère, des petits êtres hauts de seulement dix centimètres...